大花紫薇（Lagerstroemia speciosa），是千屈菜科（Lythraceae）紫薇属（Lagerstroemia）的代表性观赏植物，广泛分布于热带和亚热带地区，具有较强的耐温热性，是典型的夏季开花植物。其花朵硕大、花期长且色彩艳丽，是海南、福建、两广等地著名庭院观赏和城市园林绿化树种。此外，大花紫薇还是东南亚许多民族的民间药用植物，被广泛用于预防和治疗糖尿病，其提取物科罗索酸被称为“植物胰岛素”。

近日，北京林业大学张启翔教授团队在Scientific Data（IF5year=8.90）上发表了题为“Chromosome-level genome assembly of banaba (Lagerstroemia speciosa L.)”的研究成果，组装并注释了大花紫薇染色体水平高质量基因组。

该研究利用PacBio+Hi-C等测序技术获得了大花紫薇染色体级别基因组图谱。该基因组总大小为306.76 Mb，scaffold N50为13.03 Mb，其中98.75%的序列被锚定到24条染色体上，共注释蛋白编码基因31378个以及多类型非编码RNA。进一步分析表明，重复序列占整个基因组的38.58%（118.10 Mb）。大花紫薇基因组的高质量组装为研究紫薇属植物演化、种群结构分析及大花紫薇功能性次生代谢产物科罗索酸形成积累的分子基础提供了新见解。

图1 大花紫薇基因组组装概况与特征

该研究是继课题组完成紫薇全基因组测序、重测序研究（2023）后的又一重要成果，不断补充和完善了紫薇属功能基因组学研究的理论框架，在应用上为紫薇属花型、花色、株型、药用等重要观赏性状和品质性状分子解析、优异种质基因资源挖掘、目标性状定向遗传改良、功能性次生代谢产物富集和高值化产品开发等搭建起重要平台，对推动紫薇属植物分子育种革命奠定了重要基础。

北京林业大学园林学院在读博士研究生万志庭为论文第一作者，张启翔教授、程堂仁教授、郑唐春副教授为该论文的共同通讯作者。本研究得到了北京市科技计划项目和北京市共建项目专项资金等资助。

原文链接：https://doi.org/10.1038/s41597-024-04109-y